Para todos, Cody Banks es un adolescente como cualquier otro: ama el "patín", la "roca" y perdió los papeles con las chicas. Nadie puede sospechar que Cody ha pasado el verano en un centro de entrenamiento para los adolescentes bajo la supervisión de la CIA. Ahora que está viviendo el sueño de cualquier chico de su edad: ser un agente secreto. Considerando que está listo para su primera asignación, Cody da instrucciones a la Agencia para espiar el Dr. Connors, inventor de una lo suficientemente potente como para destruir los robots microscópicos del mundo.