Después de ser recompensados ​​por la captura de los 625 experimentos -permitiéndoles elegir el lugar de la galaxia que quieren residir-, Lilo, Stitch, Pleakley, y Jumba están involucrados en problemas pronto descubre que el malvado Doctor Hamsterviel, ha escapado de la cárcel y obligado a Jumba a crear Leroy , una criatura maligna con una sed insaciable de destrucción.Cuando Hamsterviel Dr. Leroy inicio clon, con la esperanza de crear un arma poderosa para controlar el universo, Lilo, Stitch y el resto de sus amigos tendrán que unirse para conquistar y derrotar a una poderoso enemigo.