Las cuatro tortugas mutantes Rafael, Leonardo, Michelangelo y Donatello regresan a la gran pantalla en esta película, que se enfrentará a la mayor peligro han tenido que hacer frente hasta ahora. Si bien en busca de un nuevo hogar, tortugas están de vuelta con sus enemigos, y el Clan del Pie Shredder, que están planeando una estrategia para poner fin de una vez por todas.Shredder secuestra el profesor Jordan Perry, creador de '' Moco Verde '' que hace posible la mutación de las tortugas, y utiliza su fórmula para crear grandes y peligrosos guerreros ninja a las tortugas se enfrentará si quieren derrotar al malvado criminal siempre y guardar todos sus amigos y seres queridos.