A las puertas del Kilimanjaro, la "cuna de la vida", que alberga los más misteriosos y terribles plagas: la caja de Pandora, que los gérmenes podrían suponer el fin de la humanidad en unas pocas horas. En el momento en Lara Croft, un arqueólogo intrépido, se estaba preparando para tomar el orbe que contienen las coordenadas del tesoro, un chino de mando rompe submarino en el templo y se lo lleva. Una vez que el sitio ha sido rescatado por sus fieles ayudantes Bryce y Hillary, el aventurero regresa a su mansión, donde luego recibir la visita de dos emisarios del MI-6 británico. Éstos incluyen el líder de los ladrones es otro doctor Jonathan Reiss, un megalómano inquietante sospecha de suministrar armas biológicas de alta tecnología para el mejor postor. Lara entrar inmediatamente en acción y tratar de evitar que Reiss consigue llegar a la cuna de la vida y hecho con la caja delante de ella, en un viaje que la llevará a varios rincones del mundo y obligarla a superar todo tipo de peligros.